Chacune de ces versions apportent en plus de l'implémentation des spécifications, des fonctionnalités propriétaires et des interfaces d'administration améliorés.

• Tomcat 5.x (version actuelle 5.0.16) : implémentation Servlet 2.4 et JSP 2.0


• Tomcat 4.x (version actuelle 4.1.29) : implémentation Servlet 2.3 et JSP 1.2


• Tomcat 3.x (version actuelle 3.3.1a) : implémentation Servlet 2.2 et JSP 1.1